Charlie一位巴基斯坦籍同事被怀疑是基地成员，因为他曾将自已研究的成果通过互联网发到巴基斯坦的几所大学用于改良农作物的生长，但联邦调查局却怀疑他是把生化武器制作说明进行泄密。同时在洛杉矶的一个慈善基金组织也被怀疑是恐怖组织，这个基金的两位成员被杀害，Charlie相信自己的同事是无罪，决定帮他把研究成果发送到巴基斯坦，这意味着他的忠诚调查取消，今后将无法帮助破案。Megan辞职了，她将回到学校去进修博士，同时换一份工作。